По этому поводу сейчас делается много высказываний. Одной из самых распространённых версий по поводу причины появления индиго является версия о том, что их сверхспособности являются ничем иным как результатом мутаций, вызванных действием облучения от таких предметов быта, как мобильные телефоны, компьютеры и телевизоры. Таким образом, организм человека как будто бы подготовился к жизни в высокотехнологичном обществе.

Также популярной является версия о том, что появление детей индиго на нашей планете стало возможным благодаря вмешательству НЛО, поскольку якобы уже много лет подряд большое количество женщин заявляет о том, что они имели сексуальные контакты с инопланетянами. Подобная версия вполне объясняет необычные врождённые способности детей индиго, а также их повествования об устройстве НЛО и неземных цивилизациях.

Людей, которым никогда не приходилось сталкиваться с индиго, просто поражают их интуитивные познания. Дети индиго с самого раннего возраста, с трёх или с четырёх лет, начинают задумываться о предназначении человека на земле и о смысле жизни в целом. Также дети индиго могут поражать окружающих рассказами о якобы погибшей цивилизации, которая раньше существовала на Марсе. Но нам пока что об этом известно слишком мало, и мы вынуждены только догадываться о том, откуда же им всё это может быть известно.