Многие дети индиго могут быть подвержены возникновению аллергий разного происхождения. Причём, такая предрасположенность к аллергиям у детей индиго наблюдается с самого раннего возраста. В основном это бывают пищевые аллергии. Например, это может быть аллергия на чужеродный белок, на модифицированные продукты питания, фрукты и овощи.

Помимо аллергий, дети индиго нередко страдают так называемыми лор-заболеваниями. Одной из разновидностей таких заболеваний являются частые простудные заболевания. Дети индиго нередко страдают от бронхиальной астмы. Также их часто до семилетнего возраста мучают болезни, связанные с верхними дыхательными путями. Кроме этого, у детей ндиго лор-заболевания могут возникать на совсем несерьёзной с медицинской точки зрения почве. К примру, у детей индиго часто увеличиваются аденоиды или гланды. Родители приводят детей индиго, страдающих от таких заболеваний, в поликлинику для удаления увеличенных аденоидов или гланд. Ребёнок же при этом обычно начианет активно протестовать, поскольку хорошо осведомлён о важности той функции, которую выполняют гланды или аденоиды. И ребёнок индиго никогда и никому не позволит удалить значимые для себя органы. С точки зрения медицины гланды и аденоиды не несут на себе никакой более или менее значимой функции. А с точки зрения людей индиго, гландам и аденоидам принадлежит важная функция энергетической очистки организма. Тут имеются энергетические каналы, трансформирующие энергию, поступающую в организм человека через рот. Кроме этого, гландам принадлежит также и защитная функция организма, поскольку в некоторых случаях они являются первым барьером защитыи поэтому всю силу удара принимают на себя. Также эти органы способны стабилизировать равновесие.